มาจิกา เรคคอร์ด เป็นเรื่องราวที่เกิดขึ้นในจักรวาลเดียวกับ สาวน้อยเวทมนตร์ มาโดกะ มาจิกะ แต่เป็นเรื่องราวที่แยกออกมาต่างหาก โดยมีตัวละครหลักคนใหม่คือ ทามากิ อิโรฮะ สาวน้อยที่เดินทางมายังเมือง คามิฮามะ เพื่อตามหาน้องสาวของเธอที่หายตัวไป เมืองคามิฮามะ เป็นเมืองที่พิเศษ เพราะมีพลังงานบางอย่างที่ดึงดูดเหล่าสาวน้อยเวทมนตร์ให้มารวมตัวกันที่นี่ ทำให้เมืองแห่งนี้เต็มไปด้วยสาว
น้อยเวทมนตร์ที่ต่อสู้กับเหล่าแม่มดเพื่อปกป้องเมือง อาเคมิ โฮมุระ ตัวละครที่คุ้นเคยจากเรื่องราวหลัก ก็ได้เดินทางมาที่เมืองคามิฮามะเช่นกัน โดยมีเป้าหมายเพื่อไขปริศนาของเมืองนี้ เพราะเธอเชื่อว่าหากทำความเข้าใจเมืองคามิฮามะได้ เธออาจจะสามารถช่วย มาโดกะ สาวน้อยเวทมนตร์ที่เธอรักให้พ้นจากความทุกข์ได้
![Nakanohito Genome [Jikkyouchuu] ตอนที่ 1-12 ซับไทย จบแล้ว](/storage/images/nakanohito-genome-jikkyouchuu/vT1oUjqaLLNz1XcHrSE9EnbFre3-185x278.jpg)
